合成新病毒的过程并不顺利，为此迈克给顾青岑出主意，趁埃博拉病毒再次爆发的时机去非洲原始森林寻找新的高致病性病毒。 顾青岑又去了非洲。 这一次他遇到了7年未见的谷雅南。 这7年间他虽然没出现在谷雅南面前，但一直暗中关注谷雅南的消息。 他知道她在国外博士毕业之后，又留在研究所做了一年的博士后，之后因为母亲的催促，回到国内。 她回到家乡连海市，很顺利地进入市疾控中心工作，因为出色的工作能力还成为应急办公室主任。 他也知道她的跨海大桥事故，知道她跟南翰飞的相遇、相亲、携手解决的疾控任务。 也知道她来非洲之前在机场中跟南翰飞的拥抱。 在非洲埃博拉疫区，谷雅南在处理疫情的时候，被当地人攻击，为了救心上人，顾青岑露面。 谷雅南震惊于他的突然出现。 他想找机会再次离开，可是谷雅南不幸感染埃博拉病毒，为了医治必须回国。 顾青岑担心谷雅南的安危，随着她一起回到国内。 40多天的治疗，谷雅南慢慢康复。 迈克一直注意着顾青岑的行动，当他发现谷雅南被感染埃博拉病毒又被治好了之后，他决定让顾青岑从谷雅南身边找到治疗方案，并利用跟谷雅南的关系从当地疾控中心p3实验室内寻找稀有的高致病性菌毒株。 顾青岑知道，就算他不答应，迈克也会找别人来偷盗菌毒株，到时结果会更糟，可能还会伤害到谷雅南，于是他答应了。 他先是帮助谷雅南解决了一起新型布尼亚病毒疫情，之后凭着这个功劳顺利进入谷雅南身边工作。 在与谷雅南的相处过程中，一次次解决各种疾控任务，他仿佛又回到了7年前的阳光少年。 他决定放弃人类清洗计划。 可是生物恐怖组织已经形成，他想停下脚步，却有别人推着他向前走。 迈克先是派弟弟戴维来催促顾青岑的行动。 戴维深夜来到顾青岑的单身公寓，有意无意的提起谷雅南，并告诉他之前在连海市发生的毒黄瓜和血蛊入侵事件，都是因为他的参与。 这激怒了顾青岑。 顾青岑匿名向警方举报位于废弃化工厂的实验室据点，却被戴维及时发现并清理了现场。 警方到达现场之后一无所获，但这却引起南翰飞的怀疑。 戴维想越过顾青岑，派人去疾控中心的p3实验室偷菌株。 顾青岑发觉，解决了戴维，抛尸烧香河，同时查明被戴维派去的人正是前不久刚应聘进疾控中心p3实验室的新实验员。 他及时将p3实验室的菌毒株库销毁，解决了戴维派在疾控中心的卧底，并将现场伪装成线路老化引起爆炸的样子。 迈克发现弟弟失踪，来到国内，并以大学城外教身份做掩护，出现在谷雅南和顾青岑面前。 迈克启动位于燕尾岛的实验室，并将从国外带来的志贺菌散布于南山镇的山泉水中，引起腹泻疫情，用来观察实验室培养菌株的杀伤效果。 谷雅南通过基因测序发现了南山镇的疫情为人为投放菌株，并将这个情况及时告诉南翰飞。 顾青岑知道他之前做的事情很快会被谷雅南发现，他也知道谷雅南肯定不同意他之前的做法，所以他要终止人类清洗计划，解散这个生物恐怖组织。 在给谷雅南注射了他研制的疫苗，并把他这几年的研究资料和经历全部放在一个U盘里交给谷雅南之后，他来到燕尾岛，找迈克解决整件事情。 燕尾岛的实验室里，迈克斥责顾青岑背弃了他们的信仰，他要杀了顾青岑，却被身旁的青南反杀。 顾青岑让青离离开，之后报警，将南翰飞引来燕尾岛。 他跟南翰飞交代了遗言，并让南翰飞亲眼目睹了他在火中丧生，永远在这个世界上消失。 在顾青岑留给谷雅南的U盘里，他录了一段告别视频，在视频的最后他告诉谷雅南，“雅南，你要相信我，我的本意不想伤害任何人，我杀了戴维和迈克，只是因为我生病了，我遗传了母亲的亨廷顿舞蹈症，在我23岁离开你时就已经有了初期的发病症状，我的手会不自主的颤抖，我容易被激惹，一点点小事就会让我有杀人的冲动，同时我也很抑郁，抑郁的想要自杀，甚至想让全人类为我陪葬，可是这次遇到你之后所有的抑郁，所有的易激惹都消失了，这也许是我治疗的结果，但我更相信是因为我遇到你的结果。 7年前我离开你，我是后悔的。 如果当初我没有离开你，而是把我的病情告诉你，积极接受治疗，或许不会是现在这么惨烈的样子。 不过现在所有的事情都过去了，我离开之后会有更好的人代替我守护你。 我命由我不由天，我是什么样的人，以什么样的方式生活，用什么方式死去，只有我自己才能决定。 亲爱的雅南，亲爱的家人，我离开了，请不要为我难过，因为这是我的选择。”
谷雅南把顾青岑留下的告别视频给谷爸爸、谷妈妈和哥哥谷嘉树看。 谷妈妈流着泪，“没想到青岑这孩子在7年里经历了这么多，他竟然遗传了他妈妈的病，他应该告诉我们的，我们会跟他一起面对，都怪我们，当时对他关心太少……” 谷爸爸也很伤心，安慰谷妈妈，“这孩子发病的时候正好在国外读书，我们不在身旁，天意弄人啊。”
谷嘉树：“还好恐怖组织被及时解散，警方也清理了剩下的各个实验室据点，没有造成大错，顾叔叔一家在九泉之下也可以团聚了。”
顾青岑在燕尾岛实验室爆炸中尸骨无存，谷雅南就从顾青岑的单身公寓中收拾了几件衣服，为他在顾叔叔顾阿姨坟旁立了一个衣冠冢，这样也算是一家人团聚。 衣冠冢祭奠当日，微雨纷纷。 谷雅南一家人在衣冠冢前做了简单的祭奠。 祭奠完毕，几个人撑伞离开。 雨幕之中，衣冠冢不远处的树林里，一高一矮两个人影伫立其中……